Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brpf1B2RRD7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms