Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-M5A7VMS3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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