Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scn3aA2ASI5 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms