Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

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Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubb1A2AQ07 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tubb1A2AQ07 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tubb1A2AQ07 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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