Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Syndig1A2ANU3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms