Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Fam43bA2AM80 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam43bA2AM80 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Fam43bA2AM80 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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