Protein–RNA interactions for Protein: A2AHA7

Pramel3, Preferentially-expressed antigen in melanoma-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel3A2AHA7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pramel3A2AHA7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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