Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rbbp8nlA2ABX0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rbbp8nlA2ABX0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms