Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Myom3A2ABU4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Myom3A2ABU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms