Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calcoco2A2A6M5 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calcoco2A2A6M5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms