Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm3550W4VSN7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms