Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17190V9GX38 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm17190V9GX38 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms