Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Top3bQ9Z321 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Top3bQ9Z321 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms