Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Homer1Q9Z2Y3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Homer1Q9Z2Y3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms