Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ubl3Q9Z2M6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Ubl3Q9Z2M6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ubl3Q9Z2M6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ubl3Q9Z2M6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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