Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccl8Q9Z121 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccl8Q9Z121 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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