Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Vax2Q9WTP9 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Vax2Q9WTP9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms