Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TapbpQ9R233 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms