Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Plod3Q9R0E1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms