Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nek3Q9R0A5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nek3Q9R0A5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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