Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Col4a3Q9QZS0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Col4a3Q9QZS0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms