Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms