Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ercc4Q9QZD4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms