Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ubxn8Q9QZ49 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ubxn8Q9QZ49 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms