Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rdh11Q9QYF1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms