Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Fscn3Q9QXW4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Fscn3Q9QXW4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Fscn3Q9QXW4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms