Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Kcnip3Q9QXT8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms