Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Trpc5Q9QX29 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms