Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Csnk1eQ9JMK2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Csnk1eQ9JMK2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms