Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms