Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cdc42ep4Q9JM96 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms