Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Higd1aQ9JLR9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms