Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Scube2Q9JJS0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Scube2Q9JJS0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Scube2Q9JJS0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Scube2Q9JJS0 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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