Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp29Q9ES63 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp29Q9ES63 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp29Q9ES63 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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