Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK4

Cse1l, Exportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cse1lQ9ERK4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cse1lQ9ERK4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms