Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER39

Tor1a, Torsin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor1aQ9ER39 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tor1aQ9ER39 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms