Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ndufa8Q9DCJ5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms