Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Xab2Q9DCD2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Xab2Q9DCD2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms