Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf6Q9DBU5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf6Q9DBU5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf6Q9DBU5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Rnf6Q9DBU5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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