Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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