Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Med27Q9DB40 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms