Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cnn3Q9DAW9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms