Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rsph3bQ9DA80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rsph3bQ9DA80 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms