Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smco2Q9DA21 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smco2Q9DA21 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms