Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgf29Q9DA08 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms