Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pdzd9Q9D9M4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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