Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx5Q9D8U8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx5Q9D8U8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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