Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gtf3c6Q9D8P7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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