Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Derl3Q9D8K3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Derl3Q9D8K3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms