Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl4Q9D8E6 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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